A coleção de plantas aquáticas foi inaugurada em 2012 e está localizada em um belo lago artificial. É composta por exemplares de plantas aquáticas nativas do Brasil e exóticas.

As plantas aquáticas podem ser submersas, submersas com folhas flutuantes, flutuantes e palustres. São importantes componentes dos ecossistemas aquáticos, pois servem de alimento, abrigo e desova para muitos animais. Acabam por absorver o excesso de nutrientes da água e promovem a oxigenação da água.